توالی‌دادن ژنوم کامل ای‌کولای با فناوری به اندازه کف دست

توالی‌دادن ژنوم کامل ای‌کولای با فناوری به اندازه کف دست
» سرویس: علمی و فناوری - علم و فناوری جهان
کد خبر: 94040100127
دوشنبه ۱ تیر ۱۳۹۴ - ۰۹:۲۶

دانشمندان برای نخستین بار ژنوم کامل یک موجود زنده را با استفاده از نوعی ابزار جدید که در دست جا می‌شود، توالی دادند.

به گزارش سرویس فناوری ایسنا، این محققان با استفاده از نوعی توالی‌دهنده ژنوم موسوم به MinIONTM که توسط شرکت فناوری‌هایOxford Nanopore در انگلستان ارائه شده، ژنوم باکتری ای‌کولای را به طور کامل توالی دادند.

این موفقیت، قابلیت ابزار مزبور و استفاده از آن برای توالی‌دادن ژنوم موجودات زنده پیچیده‌تر و در نهایت انسان را نشان می‌دهد.

ابزار MinIONTM چندین برابر کوچک‌تر از توالی‌دهنده‌های معمولی است و با استفاده از یک کابل یو‌اس‌بی به یک لپ‌تاپ متصل می‌شود.

با استفاده از سیستم مزبور، دانشمندان قادر به ارائه راهکارهایی برای بازسازی توالی ژنوم کامل هستند.

در حالی که توالی‌دهندگان استاندارد یا داده‌های زیادی تولید می‌کنند یا داده‌های طولانی ژنوم را برای کامل‌کردن بازسازی آن ارائه می‌دهند، ابزار جدید قادر است هر دوی این فعالیت‌ها را انجام دهد.

اندازه کوچک MinIONTM به معنای اشغال‌کردن فضای کمتر و توالی‌دادن نمونه‌های پیچیده‌تر و بزرگ‌تر است.

یکی از نقطه‌ضعف‌های فناوری ارائه‌شده این است که خوانش‌های منفردی که تولید می‌کند، در حال حاضر در مقایسه با خوانش‌های ابزارهای بزرگ‌تر، از دقت کمتری برخوردار است و ابزارهای بیوانفورماتیک قوی برای رفع‌کردن این اشتباهات لازم‌اند. شیوه‌هایی که دانشمندان در تحقیق جدید ارائه داده‌اند، قادر به غلبه‌ بر این اشتباهات و محاسبه توالی نهایی دقیق‌تری هستند.

می‌توان روزی از این فناوری برای توالی‌دادن ژنوم‌های تومور استفاده کرد و ماهیت قابل‌حمل بودن این ابزار، امکان دسترس‌پذیری بیشتر توالی‌دادن را فراهم می‌کند؛ این ابداع همچنین امکان تشخیص‌های شخصی‌شده و درمان بیماران بیشتر را مهیا می‌کند.

جزئیات این دستاورد علمی در مجله Nature Methods ارائه شد.

بررسی و طبقه‌بندی تومورهای کبدی با رویکرد جدید
» سرویس: علمی و فناوری - علم و فناوری جهان
کد خبر: 94040100393
دوشنبه ۱ تیر ۱۳۹۴ - ۱۲:۳۰

‌محققان دانشگاه پزشکی وین با استفاده از یک روش جدید تشدید مغناطیسی موفق به طبقه‌بندی نوعی تومور نادر شده‌اند که نیاز به استفاده از روشهای تهاجمی نمونه‌برداری از بافت را از بین می‌برد.

به گزارش سرویس علمی ایسنا منطقه خراسان، آدنوم از انواع نادر تومورهای کبدی است که تنها درصد خاصی از آن می‌تواند به تومور بدخیم تبدیل شود. تاکنون برای تشخیص خوش‌خیم یا بدخیم بودن سلول‌های تومور کبد، به انجام آزمایش‌های بافت‌شناسی روی نمونه‌های گرفته شده از بیماران نیاز بود که برای تهیه نمونه باید بیماران در معرض آزمایش‌های بیوپسی قرار می‌گرفتند.

محققان بخش رادیولوژی و پزشکی هسته‌ای دانشگاه وین، با بهره‌برداری از تکنیک جدید تصویر برداری موفق به تشخیص قطعی و طبقه‌بندی این نوع تومور شدند. در این روش از ماده حاجب ویژه کبد برای تصویربرداری تشدید مغناطیسی استفاده می‌شود.

تومور آدنوم نسبتا نادر است و به شکل‌های مختلفی رشد می‌کند. از این رو چهار زیرگروه برای آن در نظر گرفته می‌شود: خوش‌خیم، التهابی، پیش بدخیم و نوع چهارم که آن را نمی‌توان در هیچ دسته‌ای جا داد. احتمال بالقوه پیشرفت گروه چهارم حتی تحت دوره‌های کلینیکی وجود دارد. اکنون این فناوری جدید به محققان کمک می‌کند تا بتوانند ماهیت گروه چهارم را به راحتی تشخیص دهند.

گدوکستیک اسید، نام این ماده حاجب ویژه کبد است. این ماده، ناقل‌های صفرایی OATP و MRP را در سلول‌های آدنوم و سلول‌های سالم کبدی هدف قرار می‌دهد که این موضوع منجر به جذب ماده یا تشرح دوباره آن خواهد شد. از این طریق با بررسی تصاویر تشدید مغناطیسی و مقایسه میزان نسبی ناقلان سطحی موجود در سلول‌های کبدی سالم می‌توان تومورهای کبدی را طبقه‌بندی کرد.

بیمارستان دانشگاه کومبرا در پرتغال همچنین داده‌های بیماران را برای این تحقیق فراهم کردند.

این یافته‌ها در مجله Radiology منتشر شده است.

خویشتن خویش را ، دوست داشته باشیم .  حکیم ارد بزرگ


خویش را خوار نکنیم ، ارزش خود را براستی بدانیم .  حکیم ارد بزرگ


آدمهای بدکردار ، همگان را برای رسیدن به خواسته های خویش ، ابزار می سازند .  حکیم ارد بزرگ


بسیاری از آرزوهایمان را می توانیم به آسانی ، با نشان دادن توانمندی خویش ، به دست آوریم .  حکیم ارد بزرگ


بدترین اندیشه ها ، روان ما را به تنهایی و خلوت فرا می خوانند ، آدمیان باید درکنار هم ، شاد باشند و برای پیشرفت و امنیت سرزمین خویش ، کوشش کنند .  حکیم ارد بزرگ


خود کامگان ، در ژرفنای وجود خویش گم می شوند .  حکیم ارد بزرگ


http://orod.123.st/